-
Publications HAL de Sabeur Aridhi 2023
Journal articles
- titre
- Accuracy and diversity-aware multi-objective approach for random forest construction
- auteur
- Nour El Islem Karabadji, Abdelaziz Amara Korba, Ali Assi, Hassina Seridi, Sabeur Aridhi, Wajdi Dhifli
- article
- Expert Systems with Applications, 2023, 225 (1), pp.120138. ⟨10.1016/j.eswa.2023.120138⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.eswa.2023.120138
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-
- titre
- Molecular-evaluated and explainable drug repurposing for COVID-19 using ensemble knowledge graph embedding
- auteur
- Md Kamrul Islam, Diego Amaya-Ramirez, Bernard Maigret, Marie-Dominique Devignes, Sabeur Aridhi, Malika Smaïl-Tabbone
- article
- Scientific Reports, 2023, 13 (1), pp.3643. ⟨10.1038/s41598-023-30095-z⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1038/s41598-023-30095-z
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-
Habilitation à diriger des recherches
- titre
- Knowledge discovery from large biological graphs
- auteur
- Sabeur Aridhi
- article
- Informatique [cs]. Université de Lorraine, 2023
- typdoc
- Habilitation à diriger des recherches
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-
2022
Journal articles
- titre
- Improving automatic GO annotation with semantic similarity
- auteur
- Bishnu Sarker, Navya Khare, Marie-Dominique Devignes, Sabeur Aridhi
- article
- BMC Bioinformatics, 2022, 23 (S2), pp.433. ⟨10.1186/s12859-022-04958-7⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1186/s12859-022-04958-7
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-
- titre
- A distributed and incremental algorithm for large-scale graph clustering
- auteur
- Wissem Inoubli, Sabeur Aridhi, Haithem Mezni, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Future Generation Computer Systems, 2022, 134, pp.334-347. ⟨10.1016/j.future.2022.04.013⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.future.2022.04.013
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-
- titre
- Negative Sampling and Rule Mining for Explainable Link Prediction in Knowledge Graphs
- auteur
- Kamrul Islam, Sabeur Aridhi, Malika Smaïl-Tabbone
- article
- Knowledge-Based Systems, 2022, 250, pp.109083. ⟨10.1016/j.knosys.2022.109083⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.knosys.2022.109083
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-
- titre
- On the design of a similarity function for sparse binary data with application on protein function annotation
- auteur
- Marcelo Veras, Bishnu Sarker, Sabeur Aridhi, João Gomes, José Macêdo, Engelbert Mephu Nguifo, Marie-Dominique Devignes, Malika Smaïl-Tabbone
- article
- Knowledge-Based Systems, 2022, 238, pp.107863. ⟨10.1016/j.knosys.2021.107863⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.knosys.2021.107863
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-
Conference papers
- titre
- A Semi-supervised Graph Deep Neural Network for Automatic Protein Function Annotation
- auteur
- Akrem Sellami, Bishnu Sarker, Salvatore Tabbone, Marie-Dominique Devignes, Sabeur Aridhi
- article
- 9th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (IWBBIO), Jun 2022, Gran Canaria, Spain. pp.153-166, ⟨10.1007/978-3-031-07802-6_14⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-031-07802-6_14
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-
2021
Journal articles
- titre
- Towards big services: a synergy between service computing and parallel programming
- auteur
- Haithem Mezni, Mokhtar Sellami, Sabeur Aridhi, Faouzi Ben Charrada
- article
- Computing, 2021, 103 (11), pp.2479-2519. ⟨10.1007/s00607-021-00999-7⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1007/s00607-021-00999-7
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-
- titre
- An Experimental Evaluation of Similarity-Based and Embedding-Based Link Prediction Methods on Graphs
- auteur
- Md Kamrul Islam, Sabeur Aridhi, Malika Smaïl-Tabbone
- article
- International Journal of Data Mining & Knowledge Management Process, 2021, 11, pp.1 – 18. ⟨10.5121/ijdkp.2021.11501⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.5121/ijdkp.2021.11501
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-
Conference papers
- titre
- From competition to collaboration: Ensembling similarity-based heuristics for supervised link prediction in biological graphs
- auteur
- Md Kamrul Islam, Sabeur Aridhi, Malika Smail-Tabbone
- article
- International Conference on Bangabandhu and Digital Bangladesh 2021, Dec 2021, Dhaka, Bangladesh. pp.121-135, ⟨10.1007/978-3-031-17181-9_10⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-031-17181-9_10
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-
- titre
- Simple negative sampling for link prediction in knowledge graphs
- auteur
- Md Kamrul Islam, Sabeur Aridhi, Malika Smaïl-Tabbone
- article
- The 10th International Conference on Complex Networks and their Applications, Nov 2021, Madrid, Spain. pp.549-562, ⟨10.1007/978-3-030-93413-2_46⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-93413-2_46
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-
- titre
- Prot-A-GAN: Automatic Protein Function Annotation using GAN-inspired Knowledge Graph Embedding
- auteur
- Bishnu Sarker, Marie-Dominique Devignes, Guy Wolf, Sabeur Aridhi
- article
- ICML 2021 – Workshop on Computational Biology, Jul 2021, Virtual, United States
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Appraisal Study of Similarity-Based and Embedding-Based Link Prediction Methods on Graphs
- auteur
- Md Kamrul Islam, Sabeur Aridhi, Malika Smaïl-Tabbone
- article
- CDKP 2021 – 10th International Conference on Data Mining & Knowledge Management Process, Jul 2021, London, United Kingdom. pp.81-92, ⟨10.5121/csit.2021.111106⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.5121/csit.2021.111106
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-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- A Distributed and Incremental Algorithm for Large-Scale Graph Clustering
- auteur
- Wissem Inoubli, Sabeur Aridhi, Haithem · Mezni, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- 2021
- typdoc
- Preprints, Working Papers, …
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-
2020
Journal articles
- titre
- Special issue on “Advances on Large Evolving Graphs”
- auteur
- Sabeur Aridhi, José Macedo, Engelbert Mephu Nguifo, Karine Zeitouni
- article
- Future Generation Computer Systems, 2020, 110, pp.310. ⟨10.1016/j.future.2020.04.023⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.future.2020.04.023
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-
- titre
- GrAPFI: predicting enzymatic function of proteins from domain similarity graphs
- auteur
- Bishnu Sarker, David Ritchie, Sabeur Aridhi
- article
- BMC Bioinformatics, 2020, ⟨10.1186/s12859-020-3460-7⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1186/s12859-020-3460-7
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-
- titre
- Application of Artificial Intelligence to Gastroenterology and Hepatology
- auteur
- Catherine Le Berre, William J. Sandborn, Sabeur Aridhi, Marie-Dominique Devignes, Laure Fournier, Malika Smail-Tabbone, Silvio Danese, Laurent Peyrin-Biroulet
- article
- Gastroenterology, 2020, 158 (1), pp.76-94.e2. ⟨10.1053/j.gastro.2019.08.058⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1053/j.gastro.2019.08.058
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-
- titre
- Multiple instance learning for sequence data with across bag dependencies
- auteur
- Manel Zoghlami, Sabeur Aridhi, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- International journal of machine learning and cybernetics, 2020, 11, pp.629-642. ⟨10.1007/s13042-019-01021-5⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1007/s13042-019-01021-5
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-
Conference papers
- titre
- Optimisation Collective d’Arbres de Décision dans une Forêt Aléatoire
- auteur
- Nour El Islem Karabadji, Hassina Seridi-Bouchelaghem, Abdelaziz Amara Korba, Sabeur Aridhi, Wajdi Dhifli
- article
- 36ème Conférence sur la Gestion de Données – Principes, Technologies et Applications (BDA), Oct 2020, Paris, France. pp.42-43
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- Graph Based Automatic Protein Function Annotation Improved by Semantic Similarity
- auteur
- Bishnu Sarker, Navya Khare, Marie-Dominique Devignes, Sabeur Aridhi
- article
- IWBBIO 2020 – 8th International Work-Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, May 2020, GRANADA, Spain. pp.261-272, ⟨10.1007/978-3-030-45385-5_24⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1007/978-3-030-45385-5_24
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-
- titre
- Un algorithme distribué pour le clustering de grands graphes
- auteur
- Wissem Inoubli, Sabeur Aridhi, Haithem Mezni, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- 20ème édition de la conférence francophone « Extraction et gestion des connaissances », Jan 2020, Bruxelles, Belgique
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Special issue
- titre
- Special issue on “Advances on Large Evolving Graphs”
- auteur
- Sabeur Aridhi, José Macedo, Engelbert Mephu Nguifo, Karine Zeitouni
- article
- Future Generation Computer Systems, 110, pp.310, 2020
- typdoc
- Special issue
- Accès au bibtex
-
Poster communications
- titre
- A comparative study of similarity-based and GNN-based link prediction approaches
- auteur
- Kamrul Islam, Sabeur Aridhi, Malika Smaïl-Tabbone
- article
- GEM (Graph Embedding and Mining) workshop, ECML-PKDD 2020, Sep 2020, Ghent, Belgium
- typdoc
- Poster communications
- Accès au bibtex
-
Preprints, Working Papers, …
- titre
- A Novel Scalable Clustering Method for Distributed Networks
- auteur
- Wissm Inoubli, Sabeur Aridhi, Haithem Mezni, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- 2020
- typdoc
- Preprints, Working Papers, …
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2019
Journal articles
- titre
- The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens
- auteur
- Naihui Zhou, Yuxiang Jiang, Timothy Bergquist, Alexandra Lee, Balint Kacsoh, Alex Crocker, Kimberley Lewis, George Georghiou, Huy Nguyen, Md Nafiz Hamid, Larry Davis, Tunca Dogan, Volkan Atalay, Ahmet Rifaioglu, Alperen Dalkiran, Rengul Cetin Atalay, Chengxin Zhang, Rebecca Hurto, Peter Freddolino, Yang Zhang, Prajwal Bhat, Fran Supek, Jose Fernandez, Branislava Gemovic, Vladimir Perovic, Radoslav Davidović, Neven Sumonja, Nevena Veljkovic, Ehsaneddin Asgari, Mohammad R.K. Mofrad, Giuseppe Profiti, Castrense Savojardo, Pier Luigi Martelli, Rita Casadio, Florian Boecker, Heiko Schoof, Indika Kahanda, Natalie Thurlby, Alice C Mchardy, Alexandre Renaux, Rabie Saidi, Julian Gough, Alex Freitas, Magdalena Antczak, Fabio Fabris, Mark Wass, Jie Hou, Jianlin Cheng, Zheng Wang, Alfonso Romero, Alberto Paccanaro, Haixuan Yang, Tatyana Goldberg, Chenguang Zhao, Liisa Holm, Petri Törönen, Alan J. Medlar, Elaine Zosa, Itamar Borukhov, Ilya Novikov, Angela Wilkins, Olivier Lichtarge, Po-Han Chi, Wei-Cheng Tseng, Michal Linial, Peter Rose, Christophe Dessimoz, Vedrana Vidulin, Saso Dzeroski, Ian Sillitoe, Sayoni Das, Jonathan Gill Lees, David Jones, Cen Wan, Domenico Cozzetto, Rui Fa, Mateo Torres, Alex Warwick Vesztrocy, Jose Manuel Rodriguez, Michael Tress, Marco Frasca, Marco Notaro, Giuliano Grossi, Alessandro Petrini, Matteo Re, Giorgio Valentini, Marco Mesiti, Daniel S. Roche, Jonas Reeb, David Ritchie, Sabeur Aridhi, Seyed Ziaeddin Alborzi, Marie-Dominique Devignes, da Chen Emily Koo, Richard Bonneau, Vladimir Gligorijević, Meet Barot, Hai Fang, Stefano Toppo, Enrico Lavezzo, Marco Falda, Michele Berselli, Silvio C.E. Tosatto, Marco Carraro, Damiano Piovesan, Hafeez Ur Rehman, Qizhong Mao, Shanshan Zhang, Slobodan Vucetic, Gage Black, Dane Jo, Erica Suh, Jonathan Dayton, Dallas Larsen, Ashton Omdahl, Liam Mcguffin, Danielle Brackenridge, Patricia Babbitt, Jeffrey Yunes, Paolo Fontana, Feng Zhang, Shanfeng Zhu, Ronghui You, Zihan Zhang, Suyang Dai, Shuwei Yao, Weidong Tian, Renzhi Cao, Caleb Chandler, Miguel Amezola, Devon Johnson, Jia-Ming Chang, Wen-Hung Liao, Yi-Wei Liu, Stefano Pascarelli, Yotam Frank, Robert Hoehndorf, Maxat Kulmanov, Imane Boudellioua, Gianfranco Politano, Stefano Di Carlo, Alfredo Benso, Kai Hakala, Filip Ginter, Farrokh Mehryary, Suwisa Kaewphan, Jari Björne, Hans Moen, Martti E.E. Tolvanen, Tapio Salakoski, Daisuke Kihara, Aashish Jain, Tomislav Šmuc, Adrian M Altenhoff, Asa Ben-Hur, Burkhard Rost, Steven Brenner, Christine Orengo, Constance Jeffery, Giovanni Bosco, Deborah Hogan, Maria Martin, Claire O’donovan, Sean Mooney, Casey Greene, Predrag Radivojac, Iddo Friedberg
- article
- Genome Biology, 2019, 20 (1), ⟨10.1186/s13059-019-1835-8⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1186/s13059-019-1835-8
- Accès au bibtex
-
- titre
- A data sampling and attribute selection strategy for improving decision tree construction
- auteur
- Nour El Islem Karabadji, Ilyes Khelf, Hassina Seridi, Sabeur Aridhi, Didier Rémond, Wajdi Dhifli
- article
- Expert Systems with Applications, 2019, 129, pp.84-96. ⟨10.1016/j.eswa.2019.03.052⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.eswa.2019.03.052
- Accès au bibtex
-
- titre
- Special issue on “Uncertainty in Cloud Computing: Concepts, Challenges and Current Solutions”
- auteur
- Allel Hadjali, Haithem Mezni, Sabeur Aridhi, Andrei Tchernykh
- article
- International Journal of Approximate Reasoning, 2019, 111, pp.53-55. ⟨10.1016/j.ijar.2019.05.008⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijar.2019.05.008
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Functional Annotation of Proteins using Domain Embedding based Sequence Classification
- auteur
- Bishnu Sarker, David W. Ritchie, Sabeur Aridhi
- article
- KDIR 2019 – 11th International Conference on Knowledge Discovery and Information Retrieval, Sep 2019, Vienna, Austria. pp.163-170, ⟨10.5220/0008353401630170⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.5220/0008353401630170
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Structure Based Multiple Instance Learning Approach for Bacterial Ionizing Radiation Resistance Prediction
- auteur
- Manel Zoghlami, Sabeur Aridhi, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- KES 2019 – 23rd International Conference on Knowledge-Based and Intelligent Information & Engineering Systems, Sep 2019, Budapest, Hungary
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2018
Journal articles
- titre
- The uncertain cloud: State of the art and research challenges
- auteur
- Haithem Mezni, Sabeur Aridhi, Allel Hadjali
- article
- International Journal of Approximate Reasoning, 2018, 103, pp.139 – 151. ⟨10.1016/j.ijar.2018.09.009⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.ijar.2018.09.009
- Accès au bibtex
-
- titre
- An experimental survey on big data frameworks
- auteur
- Wissem Inoubli, Sabeur Aridhi, Haithem Mezni, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Future Generation Computer Systems, 2018, 86, pp.546 – 564. ⟨10.1016/j.future.2018.04.032⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.future.2018.04.032
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Improving memory-based user collaborative filtering with evolutionary multi-objective optimization
- auteur
- Nour El Islem Karabadji, Samia Beldjoudi, Hassina Seridi, Sabeur Aridhi, Wajdi Dhifli
- article
- Expert Systems with Applications, 2018, 98, pp.153 – 165. ⟨10.1016/j.eswa.2018.01.015⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.eswa.2018.01.015
- Accès au bibtex
-
Conference papers
- titre
- Exploiting Complex Protein Domain Networks for Protein Function Annotation
- auteur
- Bishnu Sarker, David W Ritchie, Sabeur Aridhi
- article
- Complex Networks 2018 – 7th International Conference on Complex Networks and Their Applications, Dec 2018, Cambridge, United Kingdom
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- An experimental survey on big data frameworks (Highlight paper)
- auteur
- Wissem Inoubli, Sabeur Aridhi, Haithem Mezni, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- BDA 2018 – 34ème Conférence sur la Gestion de Données – Principes, Technologies et Applications, Oct 2018, Bucarest, Romania
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- A Comparative Study on Streaming Frameworks for Big Data
- auteur
- Wissem Inoubli, Sabeur Aridhi, Haithem Mezni, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- VLDB 2018 – 44th International Conference on Very Large Data Bases : Workshop LADaS – Latin American Data Science, Aug 2018, Rio de Janeiro, Brazil. pp.1-8
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ABClass : Une approche d’apprentissage multi-instances pour les séquences
- auteur
- Manel Zoghlami, Sabeur Aridhi, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- RJCIA 2018 – 16èmes Rencontres des Jeunes Chercheurs en Intelligence Artificielle, Jul 2018, Nancy, France. pp.1-9
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- ABClass : Une approche d’apprentissage multi-instances pour les séquences(ABClass: A multiple instance learning approach for sequence data)
- auteur
- Manel Zoghlami, Sabeur Aridhi, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Actes de la Conférence Nationale d’Intelligence Artificielle et Rencontres des Jeunes Chercheurs en Intelligence Artificielle (CNIA+RJCIA 2018), 2018, Nancy, France. pp.10–18
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
-
Book sections
- titre
- An Overview of in Silico Methods for the Prediction of Ionizing Radiation Resistance in Bacteria
- auteur
- Manel Zoghlami, Sabeur Aridhi, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Tamar Reeve. Ionizing Radiation: Advances in Research and Applications, Nova science publishers, pp.241-256, 2018, Physics Research and Technology Series, 978-1-53613-539-8
- typdoc
- Book sections
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- PPI DomainMiner: predicting domain-domain interactions from protein-protein interactions using tripartite graph modeling and vector similarity
- auteur
- Seyed Ziaeddin Alborzi, Sabeur Aridhi, Dave Ritchie, Marie-Dominique Devignes
- article
- ECCB 2018 – 17th European Conference on Computational Biology, Sep 2018, Athènes, Greece
- typdoc
- Poster communications
- Accès au bibtex
-
- titre
- GrAPFI: Graph Based Inference for Automatic Protein Function Annotation
- auteur
- Bishnu Sarker, David Ritchie, Sabeur Aridhi
- article
- ECCB 2018 – 17th European Conference on Computational Biology, Sep 2018, Athens, Greece
- typdoc
- Poster communications
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2017
Journal articles
- titre
- An evolutionary scheme for decision tree construction
- auteur
- Nour El Islem Karabadji, Hassina Seridi, Fouad Bousetouane, Wajdi Dhifli, Sabeur Aridhi
- article
- Knowledge-Based Systems, 2017, 119, pp.166 – 177. ⟨10.1016/j.knosys.2016.12.011⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.knosys.2016.12.011
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- MR-SimLab: Scalable subgraph selection with label similarity for big data
- auteur
- Wajdi Dhifli, Sabeur Aridhi, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Information Systems, 2017, 69, pp.155 – 163. ⟨10.1016/j.is.2017.05.006⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.is.2017.05.006
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- BLADYG: A Graph Processing Framework for Large Dynamic Graphs
- auteur
- Sabeur Aridhi, Alberto Montresor, Yannis Velegrakis
- article
- Big Data Research, 2017, ⟨10.1016/j.bdr.2017.05.003⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bdr.2017.05.003
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Conference papers
- titre
- A Distributed Framework for Large-Scale Time-Dependent Graph Analysis
- auteur
- Wissem Inoubli, Livia Almada, Ticiana L. Coelho da Silva, Gustavo Coutinho, Lucas Peres, Regis Pires Magalhaes, Jose Antonio F. de Macedo, Sabeur Aridhi, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- ECML PKDD 2017 – TD-LSG 2017 : workshop Advances in Mining Large-Scale Time Dependent Graphs, Sep 2017, Skopje, Macedonia. pp.6
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automatic Generation of Functional Annotation Rules Using Inferred GO-Domain Associations
- auteur
- Seyed Ziaeddin Alborzi, Sabeur Aridhi, Marie-Dominique Devignes, Rabie Saidi, Alexandre Renaux, Maria-Jesus Martin, David W. Ritchie
- article
- Function-SIG ISMB/ECCB 2017, biofunctionprediction.org, Jul 2017, Prague, Czech Republic
- typdoc
- Conference papers
- Accès au texte intégral et bibtex
-
Poster communications
- titre
- Neighborhood-Based Label Propagation in Large Protein Graphs
- auteur
- Sabeur Aridhi, Seyed Ziaeddin Alborzi, Malika Smaïl-Tabbone, Marie-Dominique Devignes, David Ritchie
- article
- Function SIG @ ISMB/ECCB 2017, Jul 2017, Prague, Czech Republic. pp.2
- typdoc
- Poster communications
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Automatic Generation of Functional Annotation Rules Using Inferred GO-Domain Associations
- auteur
- Seyed Ziaeddin Alborzi, Marie-Dominique Devignes, Sabeur Aridhi, Rabie Saidi, Alexandre Renaux, Maria J. Martin, David W. Ritchie
- article
- Function-SIG ISMB/ECCB 2017, Jul 2017, Prague, Czech Republic. 2017
- typdoc
- Poster communications
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2016
Journal articles
- titre
- Big Graph Mining: Frameworks and Techniques
- auteur
- Sabeur Aridhi, Engelbert Mephu
- article
- Big Data Research, 2016, 6, pp.1-10. ⟨10.1016/j.bdr.2016.07.002⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.bdr.2016.07.002
- Accès au bibtex
-
- titre
- Prediction of Ionizing Radiation Resistance in Bacteria Using a Multiple Instance Learning Model
- auteur
- Sabeur Aridhi, Haïtham Sghaier, Manel Zoghlami, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Journal of Computational Biology, 2016, 23 (1), pp.10 – 20. ⟨10.1089/cmb.2015.0134⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1089/cmb.2015.0134
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- titre
- A multiple instance learning approach for sequence data with across bag dependencies
- auteur
- Manel Zoghlami, Sabeur Aridhi, Haïtham Sghaier, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- CoRR, 2016, abs/1602.00163
- typdoc
- Journal articles
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- titre
- Big Graph Mining: Frameworks and Techniques
- auteur
- Sabeur Aridhi, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- CoRR, 2016, abs/1602.03072
- typdoc
- Journal articles
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Conference papers
- titre
- Distributed k-core decomposition and maintenance in large dynamic graphs
- auteur
- Sabeur Aridhi, Martin Brugnara, Alberto Montresor, Yannis Velegrakis
- article
- the 10th ACM International Conference, Jun 2016, Irvine, France. pp.161-168, ⟨10.1145/2933267.2933299⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1145/2933267.2933299
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2015
Journal articles
- titre
- Density-based data partitioning strategy to approximate large-scale subgraph mining
- auteur
- Sabeur Aridhi, Laurent d’Orazio, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Inf. Syst., 2015, 48, pp.213–223. ⟨10.1016/j.is.2013.08.005⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.1016/j.is.2013.08.005
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Conference papers
- titre
- Cost models for distributed pattern mining in the cloud: application to graph patterns
- auteur
- Sabeur Aridhi, Laurent d’Orazio, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo, Laurent Dorazio, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- IEEE Trustcom/BigDataSE/ISPA , Aug 2015, Helsinki, Finland. ⟨10.1109/Trustcom.2015.569⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1109/Trustcom.2015.569
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2014
Journal articles
- titre
- Towards a constructive multilayer perceptron for regression task using non-parametric clustering. A case study of Photo-Z redshift reconstruction
- auteur
- Cyrine Arouri, Engelbert Mephu Nguifo, Sabeur Aridhi, Cécile Roucelle, Gaëlle Bonnet-Loosli, Norbert Tsopzé
- article
- CoRR, 2014, abs/1412.5513
- typdoc
- Journal articles
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-
- titre
- Un partitionnement basé sur la densité de graphe pour approcher la fouille distribuée de sous-graphes fréquents
- auteur
- Sabeur Aridhi, Laurent d’Orazio, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Revue des Sciences et Technologies de l’Information – Série TSI : Technique et Science Informatiques, 2014, 33, pp.711–737. ⟨10.3166/tsi.33.711-737⟩
- typdoc
- Journal articles
- DOI
- DOI : 10.3166/tsi.33.711-737
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-
Conference papers
- titre
- SHORTEST PATH RESOLUTION USING HADOOP
- auteur
- Sabeur Aridhi, Vincent Benjamin, Philippe Lacomme, Libo Ren
- article
- MOSIM 2014, 10ème Conférence Francophone de Modélisation, Optimisation et Simulation, Nov 2014, Nancy, France
- typdoc
- Conference papers
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-
- titre
- A novel MapReduce-based approach for distributed frequent subgraph mining
- auteur
- Sabeur Aridhi, Laurent d’Orazio, Monder Maddouri, Engelbert Mephu
- article
- Reconnaissance de Formes et Intelligence Artificielle (RFIA) 2014, Jun 2014, France
- typdoc
- Conference papers
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Other publications
- titre
- Bases de données NoSQL et Big Data : Concevoir des bases de données pour le Big Data ISBN-10 : 2340002613 ISBN-13 : 978-2340002616
- auteur
- Sabeur Aridhi, Philippe Lacomme, Raksmey Phan
- article
- /, 2014
- typdoc
- Other publications
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2013
Conference papers
- titre
- Computational phenotype prediction of ionizing-radiation-resistant bacteria with a multiple-instance learning model
- auteur
- Sabeur Aridhi, Haithem Sghaier, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- BioKDD ’13 – Proceedings of the 12th International Workshop on Data Mining in Bioinformatics, Aug 2013, Chicago, United States. ⟨10.1145/2500863.2500866⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1145/2500863.2500866
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Theses
- titre
- Distributed frequent subgraph mining in the cloud
- auteur
- Sabeur Aridhi
- article
- Other [cs.OH]. Université Blaise Pascal – Clermont-Ferrand II, 2013. English. ⟨NNT : 2013CLF22400⟩
- typdoc
- Theses
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2012
Conference papers
- titre
- Feature extraction in protein sequences classification: a new stability measure
- auteur
- Saidi Rabie, Sabeur Aridhi, Engelbert Mephu Nguifo, Mondher Maddouri
- article
- ACM BCB 2012 – Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine, Oct 2012, Orlando, United States. ⟨10.1145/2382936.2383060⟩
- typdoc
- Conference papers
- DOI
- DOI : 10.1145/2382936.2383060
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2010
Conference papers
- titre
- Etude de stabilité de méthodes d’extraction de motifs à partir des séquences protéiques
- auteur
- Rabie Saidi, Sabeur Aridhi, Mondher Maddouri, Engelbert Mephu Nguifo
- article
- Extraction et gestion des connaissances (EGC’2010), 2010, Hammamet, Tunisia. pp.703–704
- typdoc
- Conference papers
- Accès au bibtex
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