CURRICULUM VITAE

Formation

Expérience professionnelle

  • From 1980 to 1989 at the Institut Jacques Monod in Dr. Anne-Lise Haenni’s laboratory, dealing with plant viruses and molecular virology.
  • From 1990 to 2001 in Charles Auffray’s laboratory in Nogent sur Marne then in Villejuif, dealing with neurotrophin genes and human genetics.
  • From 2001 to now at the LORIA
    • Since January 1st, 2015, I am a member of the CAPSID team (Team leader : Dave Ritchie). CAPSID stands for Computational Algorithms for Protein Structure and Interactions. I am in charge of developing algorithms and strategies for structural data mining to help modeling of complex protein-protein interactions.
    • From autumn 2003 to December 31st, 2014, I have been a member of the ORPAILLEUR team (Team leader : Amedeo Napoli). I have been involved in various projects dealing with biological data integration and mining for knowledge extraction.

Centres d’intérêt et compétences

  • integration of heteogeneous complex data,
  • relational databases,
  • machine learning including clustering and classification,
  • symbolic data mining methods including relational data mining,
  • semantic web, bio-ontologies,
  • structural bioinformatics

Encadrement de thèses

  • 2013 – 2018 : Encadrement d’une Thèse en Informatique (Gabin Personeni)
  • 2014 – 2018 : Co-encadrement d’une Thèse en Informatique (Seyed Ziaeddin Alborzi, soutenue le 23 février 2018)
  • 2009 – 2013 : Co-encadrement d’une Thèse en Biologie, orientée Bioinformatique (Emmanuel Bresso)
  • 2009 – 2012 : Encadrement d’une Thèse en Informatique (Anisah Ghoorah)
  • 2008 – 2009 : Co-encadrement d’une Thèse CNAM en Informatique (Philippe Franiatte)
  • 2007 – 2011 : Encadrement d’une Thèse en Informatique (Sidahmed Benabderrahmane)
  • 2004 – 2009 : Co-encadrement d’une Thèse en Informatique (Nizar Messaï)
  • 2004 – 2008 : Encadrement d’une Thèse en Informatique (Adrien Coulet)
  • 1999 – 2000 : Co-encadrement d’une Thèse CNAM en Informatique (André Schaaf)
  • 1995 – 1999 : Encadrement  d’une Thèse en  Génétique Humaine (Fabrice Guillemot)
  • 1992 – 1996 : Encadrement d’une Thèse en Génétique Humaine (Marie-Françoise Rosier)
  • 1991 – 1996 : Encadrement d’une Thèse en Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (Annick Martin)